Effizientes DNA-Reinigungsprotokoll für die Abnahme von Fingerabdrücken von Zuckerrohr

Zuckerrohr (Saccharum officinarum L.) ist eine der führenden Nutzpflanzen der Welt. Die molekulare Charakterisierung und die durch molekulare Marker unterstützte Selektion in der Zuckerrohrzüchtung könnten ein Instrument zur Verbesserung dieser Kulturpflanze sein und zur Steigerung der Zuckerproduktion beitragen. Wie viele andere Pflanzenarten enthalten Zuckerrohrgewebe hohe Gehalte an Polysacchariden und polyphenolischen Verbindungen, die bei der DNA-Reinigung ein großes Kontaminationsproblem darstellen. Hohe Konzentrationen von Polysacchariden, die bei normalen Phenol-Chloroform-Extraktionen mit der DNA mitgereinigt werden, und Polyphenole binden kovalent an die DNA und machen sie für die meisten Forschungsanwendungen unbrauchbar. Ein schnelles, effizientes und einfaches DNA-Reinigungsverfahren für Zuckerrohr ist ein dringender Bedarf in Genomkartierungs- und Marker-Assisted-Selection (MAS)-Programmen. In der vorliegenden Untersuchung wurde eine effiziente und einfache Methode zur Isolierung qualitativ hochwertiger DNA aus Meristemzylindern in Zuckerrohr entwickelt. Mit der entwickelten Methode war eine qualitativ hochwertige DNA-Isolierung ohne Verwendung von flüssigem Stickstoff, ohne Gewebehomogenisierer und unter Verwendung einer einfachen Mikrozentrifuge möglich. Die isolierte DNA wurde für PCR-Amplifikation und DNA-Fingerprinting unter Verwendung von RAPD-Markern gut durchgeführt.

Autorentext

Md Munan Shaik has M.Sc. in Biotechnology and Genetic Engineering from Islamic University, Kushtia, Bangladesh, where he joined and working as a Lecturer now. He is has PhD in Structural Biology from University of Padova. Md Shaik published couples of research and review articles in National and International scientific journals.