Perception 3D de la zone de densité maximale sur les tracés de Rama pour le virus Zika

Le tracé de Ramachandran est l'un des concepts les plus centraux de la biologie structurelle qui utilise des angles de torsion pour décrire la conformation des polypeptides et des protéines. Pour aider à visualiser les caractéristiques des tracés de Ramachandran haute fidélité, il est utile de regarder au-delà du tracé psi-phi bidimensionnel commun, qui pour un grand ensemble de données ne sert pas très bien à transmettre la vraie nature de la distribution. En particulier, lorsqu'un grand sous-ensemble d'observations se trouve très étroitement distribué dans une petite région, cela n'est pas bien vu dans le tracé simple car les points de données s'engorgent les uns les autres. La banque de données de protéines du virus Zika (ZIKV) a été choisie comme spécimen pour l'analyse. En effet, la structure, le tropisme et la pathogenèse du ZIKV sont en grande partie inconnus et font l'objet d'études en cours dans le but de répondre au besoin de développement rapide de vaccins et de produits thérapeutiques.

Autorentext

Mayukh Mukhopadhyay - Laurea Magistrale in Ingegneria in Ingegneria del software, Facoltà di Ingegneria e Tecnologia. Dipartimento di Informatica, Facoltà di Ingegneria e Tecnologia, Università di Jadavpur, Calcutta, India.

Klappentext

Le tracé de Ramachandran est l'un des concepts les plus centraux de la biologie structurelle qui utilise des angles de torsion pour décrire la conformation des polypeptides et des protéines. Pour aider à visualiser les caractéristiques des tracés de Ramachandran haute fidélité, il est utile de regarder au-delà du tracé psi-phi bidimensionnel commun, qui pour un grand ensemble de données ne sert pas très bien à transmettre la vraie nature de la distribution. En particulier, lorsqu'un grand sous-ensemble d'observations se trouve très étroitement distribué dans une petite région, cela n'est pas bien vu dans le tracé simple car les points de données s'engorgent les uns les autres. La banque de données de protéines du virus Zika (ZIKV) a été choisie comme spécimen pour l'analyse. En effet, la structure, le tropisme et la pathogenèse du ZIKV sont en grande partie inconnus et font l'objet d'études en cours dans le but de répondre au besoin de développement rapide de vaccins et de produits thérapeutiques.