Vergleichende Genomanalyse von Salmonella spp. mittels PFGE

Salmonella spp. gilt als einer der wichtigsten Lebensmittelpathogene, die weltweit untersucht werden. Salmonellen verursachen bei Menschen und Tieren typhusartige und nicht typhusartige Krankheiten. Die genetische Verwandtschaft der Isolate wurde mithilfe der Bioinformatik-Software "Applied Math" korreliert. Zur bakteriellen Isolierung wurde eine Standardmethode zur Salmonellenisolierung verwendet. Die Kolonien auf den mikrobiellen Platten wurden mit MicroSEQ Salmonella spp. Detection Kits und dem Step One Plus RT PCR Machine von Applied Biosystems bestätigt. Mit der Software Applied Math wurde aus den PFGE-Gelen, die durch Xbal-Verdau der Stämme erzeugt wurden, und unter Verwendung von Salmonella braenderup (H9812) als Referenzstamm ein genetisches Dendrogramm erstellt. Die Technik war hilfreich bei der Korrelation der Bakterienstämme aus Geflügel- und Umweltproben.

Autorentext

Dr. Kamble Laxmikant is Professor in the school of life sciences, Rubiyaparvin Shaikh is Assistant professor in PGDMLT department and Rutika Hatkar is Assistant professor in Gramin Science College.