Vergleichende Transkriptomanalyse mittels cDNA-AFLP-Technik

Ein besseres Verständnis der molekularen Mechanismen, die an der Etablierung und Entwicklung entomopathogener Pilze beteiligt sind, kann als wichtiger Schritt auf dem Weg zu einer wirksamen Bekämpfung von Insektenschädlingen angesehen werden. Zu diesem Zweck habe ich erfolgreich zwei verschiedene PCR-basierte Ansätze - cDNA-AFLPs und quantitative Echtzeit-PCR-Analyse - angewandt, um B. bassiana-Gene zu identifizieren, die vermutlich an der Überwindung wirtsinsektspezifischer Barrieren beteiligt sind. Die cDNA-AFLP-Darstellung erwies sich bei B. bassiana als ein sehr leistungsfähiges transkriptomweites Instrument zur Entdeckung von Genen, genau wie bei vielen anderen Organismen, bei denen dieser Ansatz verwendet wurde. Ohne vorherige Sequenzinformationen war es möglich, erste Einblicke in die molekularen Prozesse zu gewinnen, die B. bassiana die metabolische Vielseitigkeit verleihen. Es müssen jedoch noch Gen-Knockout-Experimente durchgeführt werden, um ihre mutmaßliche Rolle in verschiedenen Stoffwechselwegen zu bestätigen. Das Verständnis des Zusammenhangs zwischen der Unterdrückung des Stickstoffmetabolismus und dem Fehlen verschiedener subtilisinähnlicher Proteasen während des Wachstums auf Insektenkutikula ist entscheidend für das Verständnis der metabolischen Vielseitigkeit von B. bassiana.

Autorentext

Dr. Akbar Ali Khan Pathan - Departamento de Bioquímica, Genética e Genómica.